Genel Müdürlüğün izni dâhilinde belirlenen klinik dışı numunelerde mikrobiyolojik ve biyolojik analizleri yapar. Laboratuvarda, içme ve kullanma suları, ambalajlı sular ve doğal kaynak suları için gerekli mikrobiyolojik analizleri yapılır. Ayrıca kaplıca, havuz vb. suların mikrobiyolojik analizleri yapılır.