Eskişehir Halk Sağlığı Laboratuvarı 1969 yılında Enterobakteri Laboratuvarı olarak hizmet vermeye başlamış olup, 1976 yılında yeni binasına Halk Sağlığı Laboratuvarı olarak faaliyete geçmiştir. Eskişehir ili merkezi, tüm ilçe ve köylerine hizmet vermektedir. Laboratuvarımız, Sağlık Bakanlığı Temel Sağlık Hizmetleri Genel Müdürlüğü'nün 08/05/2006 tarih ve 4893 sayılı makam onayı ile içme ve kaynak suları için " İnsani tüketim amaçlı sular hakkında yönetmelik"in Ek 2 Tablo A kontrol izlemesi bölümünde yer alan parametreler ile Ek 1 (a) denetim izlemesi bölümünde yer alan parametrelerin mikrobiyolojik analizlerini yapma konusunda yetkilendirilmiştir.
Laboratuvarımız 2007 yılında Toplam Kalite Yönetimi çalışmalarına başlamış olup, 2019 yılında revizyona gitmiştir. Kalite Yönetim Temsilcisi ve Kalite Yönetim Personeli ile kalite faaliyetlerini sürdürmektedir.